Michigan #

SNP-IT: A Single Nucleotide Polymorphism Detection Platform to Inform Antiplatelet Pharmacotherapy #

Antiplatelet medications are a common treatment for patients after experiencing thrombotic events, such as venous thromboembolism or some forms of stroke. Recently, a genetic variant— the rs773902 single nucleotide polymorphism (SNP)—was identified that may reduce efficacy of a standard-of-care antiplatelet regimen, aspirin and clopidogrel. This SNP is present in a diverse range of individuals, but is especially prevalent in those of African descent. With alternative medications available that maintain their efficacy in the presence of this SNP, our team sought to develop a point-of-care diagnostic test to detect the rs773902. We propose that physicians use this test to evaluate SNP presence in their patient and make more informed, personalized antiplatelet prescription decisions. Our team employed loop-mediated isothermal amplification and machine learning-generated fluorescent probes to design and make progress towards demonstrating efficacy of our SNP detection platform.

血栓形成イベント、例えば静脈血栓塞栓症や一部の脳卒中を経験した患者に対する一般的な治療法は抗血小板薬です。最近、rs773902という単一ヌクレオチド多型（SNP）という遺伝的変異が特定され、このSNPが骨格疾患治療の一つであるアスピリンとクロピドグレルの効果を減少する可能性があります。このSNPは個々の範囲に存在しますが、特にアフリカ系の人々に多く見られます。このSNPの存在下でも効果を維持する代替薬が利用可能なため、我々のチームはrs773902を検出するための診療所での診断テストを開発することを求めました。我々は、医師がこのテストを用いて患者のSNPの存在を評価し、より知識を持った、パーソナライズされた抗血小板薬の処方を決定することを提案します。我々のチームは、ループ媒介等温増幅と機械学習が生み出した蛍光プローブを利用して、我々のSNP検出プラットフォームの効果を示すために進歩を遂げる設計を行いました。

reference:

• iGEM Michigan Team Information
• iGEM Michigan Wiki