Manual-KY #

PFAS Detection and Characterization -inator #

PFAS (per and poly fluoroalkyl substances) are an increasingly prevalent threat. PFAS are industrial products that are resilient to degradation and widespread in the environment, including our home state of Kentucky. PFAS are responsible for a variety of human diseases, such as cancers, birth defects, autoimmune responses, and many more characterized and potentially uncharacterized impacts. PFAS testing is also very inaccessible, requiring mass spectroscopy machines that not many places have. Our project combats this problem by creating a gene circuit that causes transformed bacteria to fluoresce in the presence of PFAS, providing an accessible in situ test for PFAS. Additionally, our team also sought to gain a deeper understanding of the methods available to detect PFAS through literature searches of the molecular mechanisms of PFAS toxicity, reverse screening of proteins affected by PFAS, kinetic modeling of our gene circuit, and molecular dynamics modeling of PFAS interactions with potential signal proteins.

PFAS（パーフルオロアルキルおよびポリフルオロアルキル物質）は急速に増えつつある脅威です。 PFASは、私たちのホームステートであるケンタッキーを含む、環境中に広範囲に分布し、分解に抵抗する産業製品です。PFASは、ガン、先天性障害、自己免疫反応などの人間の病気、および特性付けられた可能性のある未特定の影響を引き起こします。PFASのテストも非常に手が届きにくく、多くの場所で使用できない質量分析機器が必要です。私たちのプロジェクトは、PFASの存在で変換された細菌が蛍光を発する遺伝子回路を作成することで、この問題に取り組んでいます。これにより、PFASの現地試験が可能となります。さらに、私たちのチームは、PFASの毒性の分子メカニズム、PFASによって影響を受けるタンパク質の逆スクリーニング、我々の遺伝子回路の動力学モデリング、および可能なシグナルタンパク質とのPFAS相互作用の分子動力学モデリングの文献を通じて、PFASを検出するための利用可能な方法に関するより深い理解を求めました。

reference:

• iGEM Manual-KY Team Information
• iGEM Manual-KY Wiki