Sheffield #

PARSE: PhAge deRived growth SlowErs #

Molecular biology workflow is significantly impacted by microbial dynamics, which itself is heavily dependent on cell growth rate. To date, an automatic plasmid system in which growth rate can be reliably predicted and instigated has not yet been developed. Such a system would have several useful applications in bioproduction, co-culturing and directed evolution. Thus, our goal is to create a system that allows for Escherichia coli growth rate to be a genetically programmable parameter. To this end we have: developed a set of plasmid constructs that characterise bacteriophage growth inhibitor genes in E. coli, delineated a protocol with which to tune these growth slowers to an inducible promoter of choice; and begun to develop a multiplexed automated turbidostat to ease the gathering of necessary data. Simultaneously, significant mathematical modelling was performed to ensure that future iGEM teams have all the tools and understanding necessary to reliably control microbial growth.

分子生物学のワークフローは、微生物のダイナミクスに大きな影響を受けており、それ自体が細胞の成長率に大きく依存しています。しかし、成長率が信頼性高く予測し、誘導できる自動プラスミドシステムは、まだ開発されていません。このようなシステムは、バイオプロダクション、共培養、directed evolutionなどの様々な用途に有用です。したがって、私たちの目標は、大腸菌の成長率を遺伝的にプログラム可能なパラメータにするシステムを作成することです。このために、私たちは大腸菌におけるﾊﾞｸﾃﾘｵﾌｧｰｼﾞ成長抑制遺伝子を特性化する一連のプラスミド構築物を開発し、これらの成長遅延物質を選択的に誘発可能なプロモータに調整するプロトコールを明確にし、必要なデータ収集を容易にする多重自動濁度調節器の開発を開始しました。同時に、正確に微生物の成長を制御するために必要なツールと理解を確保するため、大幅な数理モデリングを行いました。

reference:

• iGEM Sheffield Team Information
• iGEM Sheffield Wiki