NYCEmpireState #

Aptamers for the Detection of Stress-Related Salivary Biomarkers #

Our motivation was to create an inexpensive and non-invasive aptamer-based approach to assess saliva samples to detect acute stress by clinicians in order to diagnose patients. Through collaboration, we obtained labeled DNA probes with specificity to alpha-amylase. We used an EMSA to visualize the binding of those probes to our protein. We also began work on synthesizing a plasmid to express alpha-amylase in the lab for future experiments. We were able to show a specific interaction between the alpha-amylase and aptamer complex within a polyacrylamide gel. The interaction of the protein-DNA complex traveled a shorter distance versus probe and protein alone. The study shows that synthetic DNA oligonucleotides make for an equally efficient method to detect alpha-amylase versus the traditional ELISA antibody. In the future, we will apply this method to human samples via saliva collection which is less invasive than a blood draw.

私たちの動機は、クリニシャンが患者の診断のために急性ストレスを検出するための唾液サンプルを評価する安価で非侵襲的なアプタマー基盤のアプローチを作成することでした。協力を通じて、アルファアミラーゼに特異性を持つ標識DNAプローブを得ることができました。私たちはEMSAを用いて、これらのプローブと私たちの蛋白質との間の結合を視覚化しました。また、研究室でアルファアミラーゼを発現するプラスミドを合成する作業を開始しました。ポリアクリルアミドゲル内のアルファアミラーゼとアプタマー複合体の間の特異的な相互作用を示すことができました。蛋白質-DNA複合体の相互作用は、プローブと蛋白質だけと比較して短い距離を移動しました。この研究は、合成DNAオリゴヌクレオチドが伝統的なELISA抗体と比較してアルファアミラーゼを検出する同等に効率的な手法であることを示しています。今後、私たちは血液採取よりも侵襲性の低い唾液採取を通じてこの方法を人間のサンプルに適用します。

reference:

• iGEM NYCEmpireState Team Information
• iGEM NYCEmpireState Wiki