DTU-Denmark #

FluoroLoop - An Aptamer-Based PFAS Detection Method #

Today in Denmark, the question is not where PFAS are, but where PFAS aren’t. Our project centres around this class of forever chemicals, which accumulate in the environment and our bodies with highly detrimental effects. While efforts are made to identify the extent of the contamination, detection methods are expensive and time-consuming, primarily relying on LC/MS. Our goal is to create a quick, cheap, and easy-to-use PFAS biosensor to aid detection. To do so we use an aptamer specific for one of the most well-known PFAS, namely PFOA. We combine the aptamer with a trans-encoded genetic switch, known as a tRNA mimicking structure (TMS), which is novel to iGEM. Furthermore, we have developed the software tool AptaLoop, to aid future researchers in streamlining aptamer design and modelling.

今日、デンマークではPFASがどこにあるかではなく、PFASが存在しない場所がどこであるかが問題となっています。当プロジェクトは、環境や私たちの体に蓄積し、深刻な影響をもたらす永遠の化学物質であるこの種の化学物質を中心に展開しています。汚染の範囲を特定するための努力がなされていますが、検出方法は高価で時間がかかり、主にLC/MSに依存しています。我々の目標は、検出を支援するための迅速で安価で使い易いPFASバイオセンサーを作り出すことです。これを達成するために、我々は最もよく知られているPFAS、すなわちPFOA特有のアプタマーを使用します。我々はアプタマーと、iGEMに新たに導入されたtRNA模倣構造（TMS）と呼ばれる遺伝的なスイッチを組み合わせます。さらに、我々はアプタマーデザインとモデリングを効率化するためのソフトウェアツールAptaLoopを開発しました。

reference:

• iGEM DTU-Denmark Team Information
• iGEM DTU-Denmark Wiki